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Aparición de SARS-CoV-2 B.1.1.7 Linaje

Estados Unidos, 29 de diciembre de 202012 de enero de 2021

Verano E. Galloway, PhD 1 ;Prabasaj Paul, PhD 1 ;Duncan R. MacCannell, PhD 2 ;Michael A. Johansson, PhD 1 ;

John T. Brooks, MD 1 ;Adam MacNeil, PhD 1 ;Rachel B. Slayton, Doctora en Filosofía 1 ;Suxiang Tong, PhD 1 ;Benjamin J. Silk, PhD 1 ;Gregory L. Armstrong, MD 2 ;

Mateo Biggerstaff, ScD 1 ;Dra. Vivien G. Dugan

El 15 de enero de 2021, este informe se publicó como MMWRSalida anticipada en el sitio web de MMWR (https://www.cdc.gov/mmwr).

El 14 de diciembre de 2020, el Reino Unido informóuna variante preocupante (VOC) del SARS-CoV-2, linaje B.1.1.7,también conocido como VOC 202012/01 o 20I/501Y.V1.* ElSe estima que la variante B.1.1.7 surgió en septiembre2020 y se ha convertido rápidamente en la circulación dominanteVariante del SARS-CoV-2 en Inglaterra (1).B.1.1.7 ha sidodetectado en más de 30 países, incluido Estados Unidos.Comodel 13 de enero de 2021, aproximadamente 76 casos de B.1.1.7 hanha sido detectado en 12 estados de EE.UU.Múltiples líneas de evidenciaindican que B.1.1.7 se transmite más eficientemente queotras variantes de SARS-CoV-2 (13).La trayectoria modelada deesta variante en los EE. UU. exhibe un rápido crecimiento a principios de 2021,convirtiéndose en la variante predominante en marzo.AumentóLa transmisión del SARS-CoV-2 podría amenazar la atención médica tensarecursos, requieren una implementación más amplia y más rigurosade las estrategias de salud pública (4), y aumentar el porcentaje deinmunidad de la población necesaria para el control de la pandemia.Tomandomedidas para reducir la transmisión ahora pueden disminuir el potencialimpacto de B.1.1.7 y permitir un tiempo crítico para aumentar la vacunacobertura de ción.Colectivamente, vigilancia genómica mejoradacombinado con el cumplimiento continuo de normas públicas efectivasmedidas sanitarias, incluidas la vacunación, el distanciamiento físico,uso de mascarillas, higiene de manos y aislamiento y cuarentena,ser esencial para limitar la propagación del SARS-CoV-2, el virusque causa la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).Estratégicopruebas de personas sin síntomas pero con mayor riesgo deinfección, como aquellos expuestos al SARS-CoV-2 o que tienencontacto frecuente e inevitable con el público, proporciona otraoportunidad de limitar la propagación en curso.

Vigilancia genómica global y uso compartido rápido de código abiertoing de secuencias del genoma viral han facilitado casi en tiempo realdetección, comparación y seguimiento del SARS-CoV-2 en evoluciónvariantes que pueden informar los esfuerzos de salud pública para controlar lapandemia.Mientras que algunas mutaciones en el genoma viralemergen y luego retroceden, otros pueden conferir un avance selectivotage a la variante, incluida la transmisibilidad mejorada, de modo quetal variante puede dominar rápidamente otras variantes circulantes.

Al principio de la pandemia, las variantes del SARS-CoV-2 que conteníanla mutación D614G en la proteína espiga (S) que aumentaLa avidez de unión al receptor se convirtió rápidamente en dominante en muchosregiones geográficas (5,6).A fines del otoño de 2020, varios países informaron haber detectadoVariantes del SARS-CoV-2 que se propagan de manera más eficiente.Ademása la variante B.1.1.7, las variantes notables incluyen la B.1.351linaje detectado por primera vez en Sudáfrica y el recientemente identificadoB.1.1.28 subclade (renombradoP.1) detectado en cuatro viajerosde Brasil durante la proyección de rutina en el Haneda (Tokio)aeropuerto.§ Estas variantes llevan una constelación de muta genéticaciones, incluso en el dominio de unión al receptor de la proteína S,que es esencial para unirse a la angiotensina de la célula huésped.convertidor de enzima-2 (ACE-2) receptor para facilitar virusentrada.La evidencia sugiere que otras mutaciones encontradas en estosvariantes podrían conferir no sólo una mayor transmisibilidad, sino tambiéntambién podría afectar el rendimiento de algunos diagnósticos en tiempo realtranscripción inversareacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR)ensayosy reducir la susceptibilidad a los anticuerpos neutralizantes(2,3,510).Un reporte de caso reciente documentó el primer caso deReinfección por SARS-CoV-2 en Brasil con una variante del SARS-CoV-2que contenía la mutación E484K,** que se ha demostradopara reducir la neutralización por sueros convalecientes y monoclonalesanticuerpos (9,10).

Este informe se centra en la aparición de la variante B.1.1.7en los Estados Unidos.A partir del 12 de enero de 2021, ni elB.1.351 ni las variantes P.1 han sido detectadas en elEstados Unidos.Para obtener información sobre el SARS-CoV-2 emergentevariantes de preocupación, los CDC mantienen una página web dedicada aproporcionando información sobre variantes emergentes de SARS-CoV-2.††

 B.1.1.7 linaje (20I/501Y.V1)

La variante B.1.1.7 porta una mutación en la proteína S(N501Y) que afecta la conformación del receptor de unióndominio.Esta variante tiene otras 13 mutaciones que definen el linaje B.1.1.7 (Tabla), varias de las cuales están en la proteína S,incluyendo una supresión en las posiciones 69 y 70 (del6970) queevolucionó espontáneamente en otras variantes del SARS-CoV-2 y eshipotetizado para aumentar la transmisibilidad (2,7).la eliminaciónen las posiciones 69 y 70 provoca la falla del objetivo del gen S (SGTF)en al menos una RT-PCRensayo de diagnóstico basado (es decir, con elEnsayo ThermoFisher Taq Path COVID-19, el B.1.1.7 varihormiga y otras variantes con el del6970 producen un negativoresultado para el objetivo del gen S y un resultado positivo para los otros dosobjetivos);SGTF ha servido como representante en el Reino Unidopara identificar casos B.1.1.7 (1).Múltiples líneas de evidencia indican que B.1.1.7 es mástransmitido de manera eficiente en comparación con otros SARS-CoV-2variantes que circulan en el Reino Unido.Regiones del Reino Unido conuna mayor proporción de secuencias B.1.1.7 tuvo una epidemia más rápidacrecimiento que en otras áreas, los diagnósticos con SGTF aumentaronmás rápido que los diagnósticos no SGTF en las mismas áreas, y unmayor proporción de contactos fueron infectados por pacientes índicecon infecciones B.1.1.7 que por pacientes índice infectados conotras variantes (1,3).La variante B.1.1.7 tiene el potencial de aumentar el pan de EE. UU.trayectoria démica en los próximos meses.Para ilustrar este efecto,se desarrolló un modelo compartimental simple de dos variantes.La prevalencia actual en EE. UU. de B.1.1.7 entre todos losse desconoce el virus pero se cree que es <0.5% basado en elnúmero limitado de casos detectados y datos del SGTF (8).Parael modelo, los supuestos iniciales incluían una prevalencia B.1.1.7del 0,5% entre todas las infecciones, la inmunidad SARS-CoV-2 deinfección previa del 10%30%, un reproductor variable en el tiemponúmero (R t ) de 1.1 (transmisión mitigada pero creciente)o 0.9 (transmisión decreciente) para las variantes actuales, y una incidencia reportada de 60 casos por 100,000 personas por día en1 de enero de 2021. Estos supuestos no representan precisamentecualquier ubicación única de EE. UU., sino más bien, indican una generalización decondiciones comunes en todo el país.El cambio en R t sobretiempo resultante de la inmunidad adquirida y el aumento de prevalencia de B.1.1.7, se modeló, con el B.1.1.7 R t asumidoser una constante 1,5 veces el R t de las variantes actuales, basado enestimaciones iniciales del Reino Unido (1,3).A continuación, se modeló el impacto potencial de la vacunaciónasumiendo que se administraron 1 millón de dosis de vacuna pordía a partir del 1 de enero de 2021, y ese 95% de inmunidadse logró 14 días después de recibir 2 dosis.Específicamente,inmunidad contra la infección con cualquiera de las variantes actuales o laSe asumió la variante B.1.1.7, aunque la eficacia yla duración de la protección contra la infección sigue siendo incierta,porque estos no eran el criterio principal de valoración de los ensayos clínicospara las vacunas iniciales.En este modelo, la prevalencia de B.1.1.7 es inicialmente baja, pero debido a quees más transmisible que las variantes actuales, exhiberápido crecimiento a principios de 2021, convirtiéndose en la variedad predominantehormiga en marzo (Figura 1).Si la transmisión de corrientevariantes está aumentando (R t inicial = 1.1) o disminuyendo lentamente(R t inicial = 0.9) en enero, B.1.1.7 impulsa un cambio sustancialen la trayectoria de transmisión y una nueva fase de exponencialcrecimiento.Con la vacuna que protege contra la infección, ellas trayectorias epidémicas tempranas no cambian y B.1.1.7 se propagantodavía ocurre (Figura 2).Sin embargo, después de que B.1.1.7 se convierta en elvariante dominante, su transmisión se redujo sustancialmente.El efecto de la vacunación en la reducción de la transmisión en el corto plazoplazo fue mayor en el escenario en el que la transmisión fueya decreciendo (R t inicial = 0.9) (Figura 2).Primeros esfuerzos quepuede limitar la propagación de la variante B.1.1.7, como universal ymayor cumplimiento de las estrategias de mitigación de salud pública,permitirá más tiempo para la vacunación en curso para lograr una mayorinmunidad a nivel de población.

Discusión

Actualmente, no hay diferencia conocida en los resultados clínicos.asociado con las variantes de SARS-CoV-2 descritas;sin embargo,una mayor tasa de transmisión conducirá a más casos, aumentandoel número de personas en general que necesitan atención clínica, exaceraliviar la carga de un sistema de atención médica ya sobrecargado,y resultando en más muertes.Vigilancia genómica continuaidentificar casos B.1.1.7, así como la aparición de otrosvariantes de preocupación en los Estados Unidos, es importante para elRespuesta de salud pública al COVID-19.Mientras que los resultados del SGTFpuede ayudar a identificar posibles casos de B.1.1.7 que pueden confirmarsemediante secuenciación, identificando variantes prioritarias que no presentanSGTF se basa exclusivamente en la vigilancia basada en secuencias.

 

 

 

Designación de variante

Primera identificación  

Mutaciones características

(proteína: mutación)

Número de casos actuales confirmados por secuencia Nº de

países con

secuencias

Ubicación Fecha Estados Unidos Mundial  
B.1.1.7 (20I/501Y.V1) Reino Unido septiembre de 2020 ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T,

del36753677 SGF

S: del6970 HV, del144 Y, N501Y,

A570D, D614G, P681H, T761I,

S982A, D1118H

ORF8: parada Q27, R52I, Y73C

norte: D3L, S235F

76 15,369 36
B.1.351 (20H/501Y.V2) Sudáfrica octubre de 2020 ORF1ab: K1655N

ES: P71L

norte: T205I

S: K417N, E484K, N501Y, D614G,

A701V

0 415 13

 

P.1 (20J/501Y.V3 Brasil y Japón ene 2021 ORF1ab: F681L, I760T, S1188L,

K1795Q, del36753677 SGF, E5662D

S: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S,

K417T, E484K, N501Y, D614G,

H655Y, T1027I

ORF3a: C174G

ORF8: E92K

ORF9: Q77E

ORF14: V49L

norte: P80R

0 35 2

 

Abreviaturas: del = eliminación;E = proteína de envoltura;N = proteína de nucleocápside;ORF = marco de lectura abierto;S = proteína de pico.

La experiencia en Reino Unido y los modelos B.1.1.7presentados en este informe ilustran el impacto de una forma más contagiosavariante puede tener sobre el número de casos en una población.Elmayor transmisibilidad de esta variante requiere un aún másrigurosa implementación combinada de vacunación y mitigaciónmedidas de prevención (p. ej., distanciamiento, mascarilla e higiene de manos)para controlar la propagación del SARS-CoV-2.Estas medidas seránmás efectivos si se instituyen más temprano que tardepara frenar la propagación inicial de la variante B.1.1.7.Esfuerzos parapreparar el sistema de atención médica para nuevos aumentos repentinos de casosgarantizado.Una mayor transmisibilidad también significa que una mayordebe lograrse una cobertura de vacunación superior a la prevista paralograr el mismo nivel de control de enfermedades para proteger al públicoen comparación con variantes menos transmisibles.En colaboración con instituciones académicas, industriales, estatales, territoriales,socios tribales y locales, CDC y otras agencias federalesestán coordinando y mejorando la vigilancia genómica yesfuerzos de caracterización del virus en los Estados Unidos.Centros para el Control y la Prevención de Enfermedadescoordina los esfuerzos de secuenciación de EE. UU. a través del SARS-CoV-2Secuenciación para la respuesta a emergencias de salud pública,Epidemiología y Vigilancia (ESFERAS)§§consorcio,que incluye aproximadamente 170 instituciones participantes y promueve el intercambio abierto de datos para facilitar el uso de SARS-CoV-2datos de secuenciaPara rastrear la evolución viral del SARS-CoV-2, los CDC estánimplementar vigilancia genómica multifacética para comprenderlos procesos epidemiológicos, inmunológicos y evolutivosque dan forma a las filogenias virales (filodinámica);brote guíainvestigaciones;y facilitar la detección y caracterizaciónción de posibles reinfecciones, casos de avance de vacunas yvariantes virales emergentes.En noviembre de 2020, los CDC establecieronel programa Nacional de Vigilancia de cepas de SARS-CoV-2 (NS3)para mejorar la representatividad del SARS-CoV-2 domésticosecuencias.El programa colabora con 64 público estadounidenselaboratorios de salud para apoyar un sistema de vigilancia genómica;NS3 también está construyendo una colección de muestras de SARS-CoV-2 and secuencias para apoyar la respuesta de salud pública y científicainvestigación para evaluar el impacto de mutaciones preocupantes encontramedidas médicas recomendadas existentes.CDC tienetambién contrató con varios grandes laboratorios clínicos comercialestories para secuenciar rápidamente decenas de miles de SARS-CoV-2especímenes positivos cada mes y ha financiado siete académicosinstituciones para llevar a cabo la vigilancia genómica en colaboracióncon las agencias de salud pública, agregando así sustancialmente ala disponibilidad de datos oportunos de vigilancia genómica de todolos Estados Unidos.Además de estas iniciativas nacionales,muchas agencias de salud pública estatales y locales están secuenciando

FIGURA 1. Trayectorias de incidencia de casos simulados* de las variantes actuales de SARS-CoV-2 y la variante B.1.1.7,asumiendo que no hay vacunación comunitariay R t inicial = 1,1 (A) o R t inicial = 0,9 (B) para las variantes actualesEstados Unidos, eneroabril 2021

 

Figura 1
Figura 2
abreviaturas
Figura 1

SARS-CoV-2 para comprender mejor la epidemiología local yapoyar la respuesta de salud pública a la pandemia.Los resultados de este informe están sujetos al menos a tres límites.estacionesEn primer lugar, la magnitud del aumento de transmisibilidad en los Estados Unidos en comparación con la observada en elReino Unido sigue sin estar claro.En segundo lugar, la prevalencia deB.1.1.7 en los Estados Unidos también se desconoce en este momento, peromejorará la detección de variantes y la estimación de la prevalenciacon esfuerzos mejorados de vigilancia de EE.UU.Finalmente, mitigación localción medidas también son muy variables, lo que lleva a la variación enRt.Los resultados específicos presentados aquí se basan en simulaciones y asumió ningún cambio en las mitigaciones más allá del 1 de enero.La mayor transmisibilidad de la guerra variante B.1.1.7clama por la implementación rigurosa de estrategias de salud pública parareducir la transmisión y disminuir el impacto potencial de B.1.1.7,ganar tiempo crítico para aumentar la cobertura de vacunación.CDCLos datos de modelado muestran que el uso universal y el aumento del cumplimientoEl cumplimiento de las medidas de mitigación y la vacunación son cruciales parareducir sustancialmente el número de casos nuevos y muertes en elpróximos meses.Además, las pruebas estratégicas de personas sinsíntomas de COVID-19, pero que tienen un mayor riesgo deinfección por SARS-CoV-2, brinda otra oportunidad paralimitar la propagación en curso.Colectivamente, vigilancia genómica mejoradalanza combinada con un mayor cumplimiento de las normas de salud públicaestrategias de mitigación, incluida la vacunación, el distanciamiento físicoing, uso de mascarillas, higiene de manos y aislamiento y cuarentena,será esencial para limitar la propagación del SARS-CoV-2 yprotegiendo la salud pública.

Expresiones de gratitud

Integrantes de la Secuenciación por Emergencia de Salud Públicaconsorcio de Respuesta, Epidemiología y Vigilancia;estatales y localeslaboratorios de salud pública;Asociación de Laboratorios de Salud Pública;Equipo de respuesta de CDC COVID-19;Subdivisión de Virus Respiratorios,División de Enfermedades Virales, CDC. Formulario del Comité de Editores de Revistas Médicas para la divulgación de posiblesconflictos de interés.No se revelaron posibles conflictos de intereses.

Referencias

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Hora de publicación: 11-feb-2021